Spy x Family mengikuti Twilight, mata-mata kelas satu yang harus membuat keluarga palsu untuk mendekati seorang politisi berbahaya. Dia mengadopsi Anya, seorang gadis kecil yang bisa membaca pikiran, dan menikahi Yor, seorang pembunuh bayaran yang berusaha menyembunyikan identitasnya. Tak satu pun dari mereka tahu rahasia orang lain, menciptakan komedi kesalahpahaman saat mereka mencoba menjaga penutup mereka dan menyelesaikan misi masing-masing.
Komedi aksi Spy x Family ini menggabungkan elemen spionase dengan dinamika keluarga yang tidak mungkin. Apa yang membedakannya adalah keseimbangan sempurna antara humor yang dihasilkan dari rahasia bersama dan momen kasih sayang tulus yang berkembang antara tiga protagonis saat mereka membentuk ikatan yang tidak terduga.